圖／旗後砲台營門一景，門額題有「威震天南」四字。普通人攝影。 
清廷為了鞏固海防，派遣沈葆楨來到台灣主理各項軍事建設，並在安平和打狗兩地建築西式砲台。由於安平港無險可依，因此所建造的二鯤鯓砲台為稜堡式，務求將守備力量最大化。
打狗港的地形起伏明顯，港口外還有當時仍為沙洲半島的旗津。在英國籍工程師哈伍德（J.W. Harewood）的規劃設計下，在旗津北方的旗後山建造一座牆垣輪廓為長方形，並分隔成三個區塊的要塞，也就是旗後砲台。
圖／旗后砲台南側的操練場和砲座一景。普通人攝影。
旗后砲台所用的建材也與二鯤鯓砲台不太相同，二鯤鯓砲台主要使用紅磚以及用黏土、石灰、細砂按照一定比例混合而成的三合土。
旗后砲台除了使用紅磚以外，還用了就地取得的咾咕石（珊瑚礁石灰岩）以及從歐洲進口的混凝土，堅固程度勝過二鯤鯓砲台。
沈葆楨在打狗港規劃建造的不只有旗後砲台，在其對岸一處名為哨船頭的山丘上，也以同樣的形式建造了砲台，只是規模較小。
圖／哨船頭砲台營門一景，門額題有「雄鎮北門」四字。普通人攝影。
旗後砲台與哨船頭砲台扼守出入打狗港必經的水道兩側，旗后砲台所處地勢比哨船頭砲台來得高，因此也讓兩座砲台擁有廣泛的射擊範圍，讓交叉火網更加立體嚴密。
清光緒11年（公元1885年），歷經清法戰爭的動盪，讓清廷再次體認台灣對於國家海防的重要性，於是決定於台灣建省，並任命劉銘傳為首任台灣巡撫。
劉銘傳到台灣赴任後，也依循沈葆楨鞏固海防的政策，聘用德國籍工程師鮑恩士（Max E. Hecht）監造10座新砲台。其中一座便位於哨船頭砲台後方的壽山之上，規模比旗后砲台還大，稱作大坪頂砲台。
海拔最高的大坪頂砲台，除了負責高角度的射擊範圍外，同時還是一座「暗台」。
圖／日治時期拍攝的壽山一景，紅圈平坦處即為大坪頂砲台舊址。取自日本國立國會圖書館網站。
所謂暗台便是隱蔽山林之中，讓敵軍察覺不到的砲台；相對於大坪頂砲台，能被敵軍清楚看見的旗後及哨船頭砲台則是「明台」，吸引敵軍的注意力和火力，然後大坪頂砲台再趁其不備給予迎頭痛擊。
大坪頂砲台的出現，象徵了當時熱兵器在射程上的突破，也影響砲台設計的邏輯，逐漸重視其隱密性。
隨著甲午戰敗，台灣割讓日本，旗后等3座砲台在日軍的登陸戰中雖有積極抵抗，但仍無力可回天。大坪頂砲台所在之處後來被劃歸為日本陸軍的要塞司令部，並將其拆除改建。至今大坪頂砲台遺址仍是軍事管制區，無法窺得其貌。
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